Фонд осуществляет свою деятельность на основании Устава, утвержденного на Общем собрании учредителей 20 апреля 1999 года.
Основными направлениями деятельности являются: музееведческое, информационное и просветительское.
Фонд составляет собственную коллекцию произведений Владимира Яковлева, а также коллекцию мемориальных предметов и архивных документов, имеющих отношение к жизни и творчеству художника.
Фонд комплектует библиотеку изданий, посвященных художнику – книги, альбомы, буклеты, афиши, рукописный материал; записывает устные свидетельства современников, выявляет аудио- и видеоматериалы, связанные с жизнью и творчеством Владимира Яковлева, с целью составления фото-, фоно- , киноархива.
Одно из направлений деятельности Фонда – создание коллекции слайдов и репродукций произведений Яковлева и художников его круга, находящихся в российских и зарубежных, частных и государственных собраниях, а также работ, известных только по фотографиям и репродукциям, местонахождение которых в настоящее время установить не удается.
Фонд кумулирует текущую и ретроспективную информацию по экспозиционной истории наследия Владимира Яковлева и его творческого окружения.
В целях успешного использования всей музееведческой, археографической и библиографической информации фонд создает электронную базу данных.
Фонд устраивает выставки самостоятельно и в сотрудничестве с партнерами, проводит вечера, научные конференции, занимается издательской деятельностью.